MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw3 genomic sequence

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020265	TA	5	10	13	22	50 %	50 %	0 %	0 %	449338586
2	NC_020265	TAAA	2	8	33	40	75 %	25 %	0 %	0 %	449338586
3	NC_020265	TA	5	10	49	58	50 %	50 %	0 %	0 %	449338586
4	NC_020265	TAAA	2	8	69	76	75 %	25 %	0 %	0 %	449338586
5	NC_020265	TA	5	10	85	94	50 %	50 %	0 %	0 %	449338586
6	NC_020265	TAAA	2	8	105	112	75 %	25 %	0 %	0 %	449338586
7	NC_020265	TA	5	10	121	130	50 %	50 %	0 %	0 %	449338586
8	NC_020265	TAAA	2	8	141	148	75 %	25 %	0 %	0 %	449338586
9	NC_020265	TA	5	10	157	166	50 %	50 %	0 %	0 %	449338586
10	NC_020265	TAAA	2	8	177	184	75 %	25 %	0 %	0 %	449338586
11	NC_020265	TA	5	10	193	202	50 %	50 %	0 %	0 %	449338586
12	NC_020265	TAAA	2	8	213	220	75 %	25 %	0 %	0 %	449338586
13	NC_020265	TA	5	10	229	238	50 %	50 %	0 %	0 %	449338586
14	NC_020265	TAAA	2	8	249	256	75 %	25 %	0 %	0 %	449338586
15	NC_020265	TAT	2	6	290	295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020265	TAAA	2	8	319	326	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020265	AGA	2	6	327	332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020265	A	6	6	343	348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020265	GTA	2	6	393	398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020265	GAT	2	6	401	406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020265	A	7	7	420	426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020265	AAC	2	6	437	442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020265	TA	3	6	515	520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020265	TAAT	2	8	539	546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020265	AT	3	6	545	550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020265	TAT	2	6	553	558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020265	TAAAT	2	10	560	569	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020265	A	6	6	585	590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020265	GTAA	2	8	654	661	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020265	TAAGTA	2	12	679	690	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020265	AAT	2	6	693	698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020265	ATA	2	6	723	728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020265	ATA	2	6	747	752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020265	AT	3	6	761	766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020265	GTTG	2	8	793	800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020265	GTAA	2	8	838	845	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020265	AATTAA	2	12	868	879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020265	AGA	2	6	920	925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338587
39	NC_020265	CAAAAA	2	12	938	949	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	449338587
40	NC_020265	ATT	2	6	993	998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338587
41	NC_020265	GAA	2	6	1066	1071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338587
42	NC_020265	ACG	2	6	1142	1147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449338587
43	NC_020265	A	6	6	1171	1176	100 %	0 %	0 %	0 %	449338587
44	NC_020265	GAA	2	6	1179	1184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338587
45	NC_020265	A	6	6	1183	1188	100 %	0 %	0 %	0 %	449338587
46	NC_020265	ATT	2	6	1253	1258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338587
47	NC_020265	AAAAC	2	10	1313	1322	80 %	0 %	0 %	20 %	449338587
48	NC_020265	AGA	2	6	1395	1400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338587
49	NC_020265	ACC	2	6	1569	1574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449338588
50	NC_020265	GAT	2	6	1609	1614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338588
51	NC_020265	TAT	2	6	1630	1635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338588
52	NC_020265	ATT	2	6	1652	1657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338588
53	NC_020265	ATG	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338588
54	NC_020265	AAG	2	6	1773	1778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338588
55	NC_020265	A	6	6	1791	1796	100 %	0 %	0 %	0 %	449338588
56	NC_020265	GAC	2	6	1806	1811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449338588
57	NC_020265	AGC	2	6	1839	1844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449338588
58	NC_020265	ATG	2	6	2007	2012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338589
59	NC_020265	CAAG	2	8	2141	2148	50 %	0 %	25 %	25 %	449338589
60	NC_020265	AGA	3	9	2231	2239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338589
61	NC_020265	TTG	2	6	2343	2348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338589
62	NC_020265	AG	3	6	2432	2437	50 %	0 %	50 %	0 %	449338589
63	NC_020265	AAG	2	6	2462	2467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338589
64	NC_020265	AAG	2	6	2530	2535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338589
65	NC_020265	AGA	2	6	2558	2563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338589
66	NC_020265	TA	3	6	2571	2576	50 %	50 %	0 %	0 %	449338589
67	NC_020265	AGA	2	6	2618	2623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338589
68	NC_020265	CAT	2	6	2722	2727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338589
69	NC_020265	AAG	2	6	2752	2757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338589
70	NC_020265	AAG	2	6	2768	2773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338589
71	NC_020265	TTA	2	6	2778	2783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338589
72	NC_020265	AT	3	6	2795	2800	50 %	50 %	0 %	0 %	449338589
73	NC_020265	GAG	2	6	2841	2846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449338589
74	NC_020265	AGG	2	6	2882	2887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449338589
75	NC_020265	ATG	2	6	2911	2916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338589
76	NC_020265	A	6	6	2929	2934	100 %	0 %	0 %	0 %	449338589
77	NC_020265	AGC	2	6	2939	2944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020265	ATTA	2	8	2958	2965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020265	TAA	2	6	3026	3031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020265	AT	3	6	3096	3101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020265	TAA	3	9	3128	3136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020265	TA	3	6	3168	3173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020265	AAATA	2	10	3207	3216	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020265	A	7	7	3270	3276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020265	GAA	2	6	3282	3287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020265	GAA	2	6	3319	3324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.